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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4nscD_ | PDB header: calcium binding protein | Chain: D: PDB Molecule: calcium uptake protein 1, mitochondrial; | PDBTitle: crystal structure of cbara1 in the apo-form |
Added to library: Sat Mar 1 08:15:20 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | R | D | R | K | V | M | E | Y | E | N | R | I | R | A | Y | S | T | P | D | K | I | F | R | Y | F | A | T | L | K | V | I | S | G | E | A | E | V | F | M | T | P | E | D | F | V | R | S | I | T | P | N | E | K | Q | P | E | H | L | G | L | D | Q | Y | I | I | K | R | F | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | K | F | A | D | E | G | S | I | F | Y | T | L | G | E | C | G | L | I | S | F | S | D | Y | I | F | L | T | T | V | L | S | T | P | Q | R | N | F | E | I | A | F | K | M | F | D | L | N | G | D | G | E | V | D | M | E | E | F | E | Q | V | Q | S | I | I | R | S | Q | T | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | M | G | S | A | L | T | T | Y | F | F | G | A | D | L | K | G | K | L | T | I | K | N | F | L | E | F | Q | R | K | L | Q | H | D | V | L | K | L | E | F | E | R | H | D | P | V | D | G | R | I | T | E | R | Q | F | G | G | M | L | L | A | Y | S | G | V | Q | S | K | K | L | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | B | T | T | B | B | T | T | S | S | G | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | M | Q | R | Q | L | K | K | H | F | K | E | G | K | G | L | T | F | Q | E | V | E | N | F | F | T | F | L | K | N | I | N | D | V | D | T | A | L | S | F | Y | H | M | A | G | A | S | L | D | K | V | T | M | Q | Q | V | A | R | T | V | A | K | V | E | L | S | D | H | V | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | B | T | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | |||||||||
Sequence | D | V | V | F | A | L | F | D | C | D | G | N | G | E | L | S | N | K | E | F | V | S | I | M | K | Q | R | L | M | R | G | L | T | R | L | M | Q | A | M | W | K | C | A | Q | E | T | ||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | S | S | S | B | S | T | T |
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