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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4np4A_ | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: toxin b; | PDBTitle: clostridium difficile toxin b crop domain in complex with fab domains2 of neutralizing antibody bezlotoxumab |
Added to library: Sat May 24 08:30:54 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | L | I | Y | I | N | D | S | L | Y | Y | F | K | P | P | V | N | N | L | I | T | G | F | V | T | V | G | D | D | K | Y | Y | F | N | P | I | N | G | G | A | A | S | I | G | E | T | I | I | D | D | K | N | Y | Y | F | N | Q | S | G | V | L | Q | T | G | V | F | S | T | E | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | F | K | Y | F | A | P | A | N | T | L | D | E | N | L | E | G | E | A | I | D | F | T | G | K | L | I | I | D | E | N | I | Y | Y | F | D | D | N | Y | R | G | A | V | E | W | K | E | L | D | G | E | M | H | Y | F | S | P | E | T | G | K | A | F | K | G | L | N | Q | I | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | B | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | Y | K | Y | Y | F | N | S | D | G | V | M | Q | K | G | F | V | S | I | N | D | N | K | H | Y | F | D | D | S | G | V | M | K | V | G | Y | T | E | I | D | G | K | H | F | Y | F | A | E | N | G | E | M | Q | I | G | V | F | N | T | E | D | G | F | K | Y | F | A | H | H | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | T | T | T | T | T | T | T | T | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . |
Sequence | E | D | L | G | N | E | E | G | E | E | I | S | Y | S | G | I | L | N | F | N | N | K | I | Y | Y | F | D | D | S | F | T | A | V | V | G | W | K | D | L | E | D | G | S | K | Y | Y | F | D | E | D | T | A | E | A | Y | I | L | E | H | H | H | |||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | B | T | T | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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