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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4nooA_ | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: vgrg protein; | PDBTitle: molecular mechanism for self-protection against type vi secretion2 system in vibrio cholerae |
Added to library: Sat Apr 12 08:17:46 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | W | P | L | G | K | T | S | E | K | Y | E | S | A | G | R | G | P | G | V | I | S | T | G | N | G | D | Y | G | G | A | S | Y | G | C | Y | Q | X | S | S | N | L | G | V | V | Q | K | Y | I | Q | S | S | K | F | K | E | F | F | S | G | L | N | P | A | T | K | E | F | N | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | G | G | G | G | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | W | Q | D | I | A | S | R | Y | P | Q | E | F | R | E | E | Q | H | Q | F | I | K | R | T | H | Y | D | I | Q | I | G | H | L | R | G | K | G | L | L | F | E | H | N | R | A | A | V | H | D | L | I | W | S | T | S | V | Q | F | G | G | R | T | N | L | I | F | N | A | L | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | B | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 |
Sequence | G | Q | N | X | E | S | X | T | D | K | D | I | I | I | L | V | Q | D | Y | K | L | V | N | T | E | R | L | F | K | S | S | P | S | W | W | S | D | L | K | K | R | A | V | S | E | K | K | A | L | L | E | L | E | I | D | G | L | E | V | D | ||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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