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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4nkhA_ | PDB header: ligase | Chain: A: PDB Molecule: e3 ubiquitin-protein ligase ssph1; | PDBTitle: crystal structure of ssph1 lrr domain |
Added to library: Sat Jan 11 09:56:12 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | Y | D | A | V | W | S | K | W | E | R | D | A | P | A | G | E | S | P | G | R | A | A | V | V | Q | E | M | R | D | C | L | N | N | G | N | P | V | L | N | V | G | A | S | G | L | T | T | L | P | D | R | L | P | P | H | I | T | T | L | V | I | P | D | N | N | L | T | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | E | L | P | E | G | L | R | E | L | E | V | S | G | N | L | Q | L | T | S | L | P | S | L | P | Q | G | L | Q | K | L | W | A | Y | N | N | W | L | A | S | L | P | T | L | P | P | G | L | G | D | L | A | V | S | N | N | Q | L | T | S | L | P | E | M | P | P | A | L | R | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | R | V | S | G | N | N | L | T | S | L | P | A | L | P | S | G | L | Q | K | L | W | A | Y | N | N | R | L | T | S | L | P | E | M | S | P | G | L | Q | E | L | D | V | S | H | N | Q | L | T | R | L | P | Q | S | L | T | G | L | S | S | A | A | R | V | Y | L | D | G | N | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | G | G | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | L | S | V | R | T | L | Q | A | L | R | D | I | I | G | H | S | G | I | R | I | H | F | D | M | A | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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