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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4nikB_ | PDB header: oncoprotein/immune system | Chain: B: PDB Molecule: single-chain fv fragment antibody; | PDBTitle: structure of human gankyrin in complex to the single chain antibody f5 |
Added to library: Sat Sep 13 08:53:40 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | V | Q | L | V | E | S | G | G | S | L | V | K | P | G | G | S | L | R | L | S | C | A | A | S | G | F | T | F | S | N | Y | S | M | N | W | V | R | Q | A | P | G | K | G | L | E | W | I | S | S | I | S | G | S | S | R | Y | I | Y | Y | A | D | F | V | K | G | R | F | T | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | R | D | N | A | T | N | S | L | Y | L | Q | M | N | S | L | R | A | E | D | T | A | V | Y | Y | C | V | R | G | V | I | D | K | F | D | Y | W | G | R | G | T | L | V | T | V | S | A | S | Q | S | V | L | T | Q | P | A | S | V | S | G | S | P | G | Q | S | I | T | I | S | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | G | G | G | T | T | S | B | B | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | G | T | S | S | D | V | G | G | Y | N | Y | V | S | W | Y | Q | Q | H | P | G | K | A | P | K | L | M | I | Y | E | D | S | K | R | P | S | G | V | S | N | R | F | S | G | S | K | S | G | N | T | A | S | L | T | I | S | G | L | Q | A | E | D | E | A | D | Y | Y | C | I | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S | B | T | T | T | B | T | T | S | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||
Sequence | Y | I | S | S | N | T | R | L | F | G | G | G | T | K | L | A | V | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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