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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4nf0E_ | PDB header: transport protein | Chain: E: PDB Molecule: probable c4-dicarboxylate-binding protein; | PDBTitle: crystal structure of a trap periplasmic solute binding protein from2 pseudomonas aeruginosa pao1 (pa4616), target efi-510182, with bound3 l-malate |
Added to library: Sat Nov 23 08:30:11 2013 | |
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Sequence | I | K | F | S | H | V | V | S | D | D | T | P | K | G | K | G | A | L | L | F | V | E | V | Y | P | N | S | T | L | F | G | D | A | D | E | I | E | A | L | R | A | N | K | V | Q | M | L | A | T | S | L | T | K | Q | L | Q | V | F | D | L | P | F | L | F | D | D | L | E | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S | S | B | T | T | G | G | G | G | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | R | F | Q | K | S | M | A | K | H | G | I | Y | G | L | A | Y | W | N | N | G | M | K | Q | L | S | A | T | R | E | L | H | R | P | D | D | A | K | G | L | V | F | R | I | Q | P | S | S | V | L | E | A | Q | F | A | M | L | G | A | T | A | K | Q | L | S | Y | A | E | T | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | G | T | S | S | S | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | A | M | Q | A | G | S | V | Q | G | T | E | N | T | W | S | N | L | A | G | Q | K | I | D | S | V | Q | P | Y | I | T | E | T | N | H | G | A | L | S | Y | M | L | I | T | L | E | S | I | V | D | E | V | T | L | V | V | N | K | E | A | E | A | L | N | Q | K | E | R | E | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | L | A | A | G | K | S | R | L | V | S | L | S | A | E | E | H | E | A | W | R | N | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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