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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4narA_ | PDB header: isomerase | Chain: A: PDB Molecule: putative uronate isomerase; | PDBTitle: crystal structure of the q9wys3 protein from thermotoga maritima.2 northeast structural genomics consortium target vr152 |
Added to library: Sat Nov 9 08:26:49 2013 | |
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Sequence | Y | L | E | G | D | P | L | T | E | E | K | I | K | E | G | L | S | K | L | V | E | D | L | G | K | V | K | K | V | L | V | V | H | T | D | Y | T | R | V | D | F | T | H | L | V | A | K | N | L | Y | R | F | L | L | E | R | G | L | K | E | F | H | T | L | N | A | S | G | T | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | T | X | K | I | E | E | F | E | K | K | L | G | I | S | R | N | E | R | R | V | F | F | H | N | H | E | F | F | N | P | E | A | L | A | F | V | G | T | L | P | A | G | F | V | S | E | X | T | E | G | D | L | E | E | E | I | P | I | K | V | N | R | L | L | F | E | D | F | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | S | S | S | G | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | I | F | F | I | N | G | T | V | P | H | E | S | T | G | F | S | G | G | L | K | I | V | I | P | G | I | A | S | T | E | V | V | D | T | F | H | W | A | A | V | L | X | G | I | P | K | L | I | G | T | V | D | N | P | A | R | K | I | I | N | R | A | S | E | X | I | F | E | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | G | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | K | A | R | S | F | T | L | N | X | V | Y | E | E | E | E | E | V | I | P | R | A | L | Y | I | D | E | G | Y | E | G | F | L | R | A | Y | E | K | A | C | E | L | S | S | Q | L | H | V | K | Y | I | D | R | P | L | R | R | A | V | Q | V | I | G | E | E | Y | D | E | V | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | T | A | G | K | G | S | Y | K | L | Q | R | P | G | V | X | A | K | G | G | Q | I | I | I | Y | A | P | H | I | K | R | F | H | S | N | P | Q | X | D | K | W | I | R | E | I | G | Y | H | C | K | D | Y | V | K | W | Y | L | K | K | H | P | D | F | N | K | N | V | A | A | H | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 400 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 410 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 420 |
Sequence | I | N | V | R | G | A | G | T | F | D | P | E | T | G | K | E | E | F | E | F | D | V | I | L | A | T | S | I | P | E | D | E | C | R | A | V | N | L | G | Y | X | D | P | S | K | I | K | K | E | D | F | X | D | E | D | S | L | W | I | V | P | G | G | K | Y | L | Y | D | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | S | T | T | G | G | G | G | G | G | G | S | T | T | S | S | T | T | T | S |
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