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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4n9f1_ | PDB header: ligase/viral protein | Chain: 1: PDB Molecule: virion infectivity factor; | PDB Fragment:unp residues 1-176; |
Added to library: Sat Jan 11 09:02:39 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | R | W | Q | V | M | I | V | W | Q | V | D | R | M | R | I | N | T | W | K | R | L | V | K | H | H | M | Y | I | S | R | K | A | K | D | W | F | Y | R | H | H | Y | E | S | T | N | P | K | I | S | S | E | V | H | I | P | L | G | D | A | K | L | V | I | T | T | Y | W | G | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | T | G | E | R | D | W | H | L | G | Q | G | V | S | I | E | W | R | K | K | R | Y | S | T | Q | V | D | P | D | L | A | D | Q | L | I | H | L | H | Y | F | D | C | F | S | E | S | A | I | R | N | T | I | L | G | R | I | V | S | P | R | C | E | Y | Q | A | G | H | N | K | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | |||||||||||||||||||
Sequence | G | S | L | Q | Y | L | A | L | A | A | L | I | K | P | K | Q | I | K | P | P | L | P | S | V | R | K | L | T | E | D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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