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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4n5qA_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: transient receptor potential cation channel subfamily v | PDBTitle: crystal structure of the n-terminal ankyrin repeat domain of trpv3 |
Added to library: Sat Feb 1 09:54:44 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | R | L | K | K | R | I | F | A | A | V | S | E | G | C | V | E | E | L | R | E | L | L | Q | D | L | Q | D | L | C | R | R | R | R | G | L | D | V | P | D | F | L | M | H | K | L | T | A | S | D | T | G | K | T | C | L | M | K | A | L | L | N | I | N | P | N | T | K | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | T | B | T | T | T | B | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | R | I | L | L | A | F | A | E | E | N | D | I | L | D | R | F | I | N | A | E | Y | T | E | E | A | Y | E | G | Q | T | A | L | N | I | A | I | E | R | R | Q | G | D | I | T | A | V | L | I | A | A | G | A | D | V | N | A | H | A | K | G | V | F | F | N | P | K | Y | Q | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | G | F | Y | F | G | E | T | P | L | A | L | A | A | C | T | N | Q | P | E | I | V | Q | L | L | M | E | N | E | Q | T | D | I | T | S | Q | D | S | R | G | N | N | I | L | H | A | L | V | T | V | A | E | D | F | K | T | Q | N | D | F | V | K | R | M | Y | D | M | I | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||
Sequence | R | S | G | N | W | E | L | E | T | M | R | N | N | D | G | L | T | P | L | Q | L | A | A | K | M | G | K | A | E | I | L | K | Y | I | L | S | R | E | I | |||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | T | T | T | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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