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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4n0qD_ | PDB header: transport protein | Chain: D: PDB Molecule: leu/ile/val-binding protein homolog 3; | PDBTitle: crystal structure of an abc transporter, substrate-binding protein2 from brucella melitensis 16m in complex with l-leucine using a3 crystal grown in a crystal former (microlytic) |
Added to library: Sat Nov 9 09:06:40 2013 | |
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Sequence | D | I | T | I | G | V | I | A | P | L | T | G | P | V | A | A | F | G | D | Q | V | K | K | G | A | E | T | A | V | E | V | I | N | K | A | G | G | I | K | G | E | K | V | V | L | K | F | A | D | D | A | G | E | P | K | Q | G | V | S | A | A | N | Q | I | V | G | D | G | I | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | V | V | G | L | V | T | T | G | V | A | V | P | V | S | D | V | L | S | E | N | G | V | L | M | V | T | P | T | A | T | G | P | D | L | T | A | R | G | L | E | N | V | F | R | T | C | G | R | D | G | Q | Q | A | E | V | M | A | D | Y | V | L | K | N | M | K | D | K | K | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | G | G | G | G | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | V | I | H | D | K | G | A | Y | G | K | G | L | A | D | A | F | K | A | A | I | N | K | G | G | I | T | E | V | H | Y | D | S | V | T | P | G | D | K | D | F | S | A | L | V | T | K | L | K | S | A | G | A | E | V | V | Y | F | G | G | Y | H | A | E | G | G | L | L | S | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | Q | L | H | D | A | G | M | Q | A | L | V | L | G | G | E | G | L | S | N | T | E | Y | W | A | I | G | G | T | N | A | Q | G | T | L | F | T | N | A | K | D | A | T | K | N | P | A | A | K | D | A | I | Q | A | L | K | A | K | N | I | P | A | E | A | F | T | M | N | A | Y | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | G | G | G | G | T | T | S | T | T | T | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . |
Sequence | A | V | E | V | I | K | A | G | I | E | R | A | G | S | T | D | D | S | A | A | V | A | K | A | L | H | D | G | K | P | I | E | T | A | I | G | T | L | T | Y | S | E | T | G | D | L | S | S | P | S | F | D | I | F | K | W | D | D | G | K | I | V | G | L | L | |||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | S | T | T | B | T | T | S | S | B | S | S | T | T |
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