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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4mvtC_ | PDB header: ligase | Chain: C: PDB Molecule: e3 sumo-protein ligase pias3; | PDBTitle: crystal structure of sumo e3 ligase pias3 |
Added to library: Sat Oct 19 08:26:24 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | V | T | M | K | P | L | P | F | Y | E | V | Y | G | E | L | I | R | P | T | T | L | E | E | A | H | F | T | F | A | L | T | P | Q | Q | V | Q | Q | I | L | T | S | R | D | Y | T | I | Q | V | Q | L | R | F | C | L | C | E | T | S | C | P | Q | E | D | Y | F | P | P | N | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | S | S | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | V | K | V | N | G | K | L | C | P | L | P | G | Y | R | P | S | R | P | I | N | I | T | P | L | A | R | L | S | A | T | V | P | N | T | I | V | V | N | W | S | S | R | N | Y | S | L | S | V | Y | L | V | R | Q | L | T | A | G | T | L | L | Q | K | L | R | A | K | G | I | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | S | S | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | P | D | H | S | R | A | L | I | K | E | K | L | T | A | D | P | D | S | E | V | A | T | T | S | L | R | V | S | L | M | C | P | L | G | K | M | R | L | T | V | P | C | R | A | L | T | C | A | H | L | Q | S | F | D | A | A | L | Y | L | Q | M | N | E | K | K | P | T | W | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | S | B | T | T | T | S | B | S | S | T | T | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | ||||||
Sequence | C | P | V | C | D | K | K | A | P | Y | E | S | L | I | I | D | G | L | F | M | E | I | L | S | S | C | S | D | C | D | E | I | Q | F | M | E | D | G | S | W | C | P | M | |||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | B | G | G | G | B | S | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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