|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4mngE_ | PDB header: immune system | Chain: E: PDB Molecule: tra@ protein, ti antigen cd3-associated protein gamma chain | PDBTitle: structure of the dp10.7 tcr with cd1d-sulfatide |
Added to library: Sat Jan 11 09:51:16 2014 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | Q | K | V | T | Q | A | Q | S | S | V | S | M | P | V | R | K | A | V | T | L | N | C | L | Y | E | T | S | W | W | S | Y | Y | I | F | W | Y | K | Q | L | P | S | K | E | M | I | F | L | I | R | Q | G | S | D | E | Q | N | A | K | S | G | R | Y | S | V | N | F | K | K | A | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | S | V | A | L | T | I | S | A | L | Q | L | E | D | S | A | K | Y | F | C | A | L | G | E | P | S | Y | W | G | F | P | R | T | T | R | V | I | F | G | K | G | T | R | V | T | V | E | P | T | K | S | V | I | R | Q | T | G | S | S | A | E | I | T | C | D | L | A | E | G | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | G | G | G | B | T | T | B | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | G | Y | I | H | W | Y | L | H | Q | E | G | K | A | P | Q | R | L | L | Y | Y | D | S | Y | T | S | S | V | V | L | E | S | G | I | S | P | G | K | Y | D | T | Y | G | S | T | R | K | N | L | R | M | I | L | R | N | L | I | E | N | D | S | G | V | Y | Y | C | A | T | W | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | K | Y | Y | K | K | L | F | G | S | G | T | K | L | I | I | T | D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|