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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4mkmA_ | PDB header: unknown function | Chain: A: PDB Molecule: putative surface anchored protein; | PDBTitle: repeat domains 1 & 2 of clostridium perfringens cpe0147 |
Added to library: Sat Dec 7 08:21:33 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | G | T | L | K | T | T | V | A | A | D | G | V | N | G | S | S | E | K | E | A | L | V | S | F | E | N | S | K | D | G | V | D | V | K | D | T | I | D | Y | K | D | L | V | A | N | E | K | Y | N | L | T | G | K | L | X | H | V | K | D | D | G | S | L | E | E | V | A | T | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | T | E | V | T | A | V | E | N | G | S | G | Q | W | E | L | D | F | G | N | Q | K | L | Q | V | G | E | K | Y | V | V | F | E | N | A | E | S | V | E | N | L | I | D | T | D | N | N | Y | E | L | D | T | K | Q | V | V | K | H | E | D | K | N | D | K | A | Q | T | L | I | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | K | P | N | L | P | E | V | K | D | G | T | L | R | T | T | V | I | A | D | G | V | N | G | S | S | E | K | E | A | L | V | S | F | E | N | S | K | D | G | V | D | V | K | D | T | I | N | Y | E | G | L | V | A | N | Q | N | Y | T | L | T | G | T | L | X | H | V | K | A | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | S | L | E | E | I | A | T | K | T | T | N | V | T | A | G | E | N | G | N | G | T | W | G | L | D | F | G | N | Q | K | L | Q | V | G | E | K | Y | V | V | F | E | N | A | E | S | V | E | N | L | I | D | T | D | K | D | Y | N | L | D | T | K | Q | V | V | K | H | E | D | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | S | S | B | S | S | S | S | S | B | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | N | D | K | A | Q | T | L | V | V | E | K | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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