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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4mjkA_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: crispr protein; | PDBTitle: crystal structure of a crispr protein from archaeoglobus fulgidus |
Added to library: Sat Sep 6 08:15:50 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | X | I | G | Y | L | V | D | V | E | F | V | W | G | F | Q | A | R | I | A | G | L | S | K | T | S | P | S | F | Y | Y | P | P | P | T | T | F | L | G | A | V | A | E | A | I | A | K | D | K | G | I | G | K | E | I | I | S | E | L | G | E | N | L | L | A | I | G | W | K | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | C | T | P | L | R | Y | S | D | I | N | R | I | L | A | D | L | A | K | S | F | D | S | P | A | R | G | K | T | I | L | S | S | L | N | D | E | A | P | K | I | R | W | F | L | V | F | K | E | E | A | V | E | E | K | I | L | W | K | I | H | R | I | G | S | K | E | S | R | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | B | S | S | S | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | V | V | D | V | K | K | V | K | V | T | Q | K | D | G | L | I | S | T | D | Y | S | F | P | A | E | D | G | V | E | L | R | G | I | L | S | Q | R | W | E | F | E | V | Y | L | N | P | F | E | V | K | X | S | Y | I | S | G | K | K | A | V | L | Y | R | I | P | I | X | T | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | F | S | T | P | E | C | L | V | E | V | G | G | D | F | K | A | Y | E | A | G | G | E | V | V | I | G | R | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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