|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4mh6A_ | PDB header: unknown function | Chain: A: PDB Molecule: putative type iii secretion protein ysco; | PDBTitle: 2.8 angstrom crystal structure of type iii secretion protein ysco from2 vibrio parahaemolyticus |
Added to library: Sat Sep 14 08:27:03 2013 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | G | T | E | N | L | Y | F | Q | S | N | A | X | I | E | R | L | L | E | I | K | K | I | R | A | D | R | A | D | K | A | V | Q | R | Q | E | Y | R | V | A | N | V | A | A | E | L | Q | K | A | E | R | S | V | A | D | Y | H | V | W | R | Q | E | E | E | E | R | R | F | A | K | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | Q | Q | T | V | L | L | K | E | L | E | T | L | R | Q | E | I | A | L | L | R | E | R | E | A | E | L | K | Q | R | V | A | E | V | K | V | T | L | E | Q | E | R | T | L | L | K | Q | K | Q | Q | E | A | L | Q | A | H | K | T | K | E | K | F | V | Q | L | Q | Q | Q | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | E | Q | S | R | Q | Q | Q | Y | Q | E | E | L | E | Q | E | E | F | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|