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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4mbrA_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: serine-rich repeat protein 2; | PDBTitle: 3.65 angstrom crystal structure of serine-rich repeat protein (srr2)2 from streptococcus agalactiae |
Added to library: Sat Nov 9 08:45:50 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | Q | G | Q | D | V | T | D | K | L | Q | N | L | D | I | K | L | S | G | G | V | Q | A | K | A | G | V | I | N | M | D | K | S | E | S | M | H | M | S | L | K | F | T | I | D | S | V | N | R | G | D | T | F | E | I | K | L | S | D | N | I | D | T | N | G | A | S | N | Y | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | V | E | P | I | K | S | P | T | G | E | V | Y | A | T | G | I | Y | D | S | Q | K | K | S | I | V | Y | S | F | T | D | F | A | A | S | K | N | N | I | N | G | I | L | D | I | P | L | W | P | D | D | T | T | V | Q | N | T | K | E | D | V | L | F | S | V | K | I | K | D | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | A | T | I | K | E | T | V | K | Y | D | P | P | V | R | I | D | F | A | G | G | V | S | V | D | S | R | I | T | N | I | D | D | V | G | K | K | M | T | Y | I | S | Q | I | N | V | D | G | K | S | L | Y | N | Y | N | G | L | Y | T | R | I | Y | N | Y | S | K | E | S | T | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | L | K | N | S | T | I | K | I | Y | K | T | T | S | D | N | I | V | E | S | M | V | Q | D | Y | S | S | M | E | D | V | T | S | K | F | A | N | S | Y | P | E | K | G | W | Y | D | I | Y | W | G | Q | F | I | A | S | N | E | T | Y | V | I | V | V | E | T | P | F | T | N | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||
Sequence | V | T | L | N | T | T | L | S | D | Y | N | E | N | N | G | V | E | H | N | H | T | Y | S | S | E | S | G | Y | S | D | V | N | A | Q | E | R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
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