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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4mboA_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: serine-rich repeat adhesion glycoprotein (srr1); | PDBTitle: 1.65 angstrom crystal structure of serine-rich repeat adhesion2 glycoprotein (srr1) from streptococcus agalactiae |
Added to library: Sat Nov 9 08:35:58 2013 | |
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Sequence | M | L | G | K | D | V | S | S | E | L | Q | K | V | N | I | A | L | K | D | N | T | L | S | E | P | G | T | V | K | L | D | S | S | E | N | L | V | L | N | F | A | F | S | I | A | S | V | N | E | G | D | V | F | T | V | K | L | S | D | N | L | D | T | Q | G | I | G | T | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | G | G | G | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | V | Q | D | I | M | D | E | T | G | Q | L | L | A | T | G | S | Y | S | P | L | T | H | N | I | T | Y | T | W | T | R | Y | A | S | T | L | N | N | I | K | A | R | V | N | M | P | V | W | P | D | Q | R | I | I | S | K | T | T | S | D | K | Q | C | F | T | A | T | L | N | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | V | A | S | I | E | E | R | V | Q | Y | N | S | P | S | V | T | E | H | T | N | V | K | T | N | V | R | S | R | I | M | K | L | D | D | E | R | Q | T | E | T | Y | I | T | Q | I | N | P | E | G | K | E | M | Y | F | A | S | G | L | G | N | L | Y | T | I | I | G | S | D | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | P | V | N | L | L | N | A | E | V | K | I | L | K | T | N | S | K | N | L | T | D | S | M | D | Q | N | Y | D | S | P | E | F | E | D | V | T | S | Q | Y | S | Y | T | N | D | G | S | K | I | T | I | D | W | K | T | N | S | I | S | S | T | T | S | Y | V | V | L | V | K | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | S | T | T | S | T | T | G | G | G | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||
Sequence | P | Q | S | G | V | L | Y | S | T | V | S | D | I | N | Q | T | Y | G | S | K | Y | S | Y | G | H | T | N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S |
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