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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4m7fB_ | PDB header: sugar binding protein | Chain: B: PDB Molecule: fibrinogen c domain-containing protein 1; | PDBTitle: crystal structure of tetrameric fibrinogen-like recognition domain of2 fibcd1 with bound mannac |
Added to library: Sat Jan 11 09:59:39 2014 | |
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Sequence | S | R | P | R | D | C | L | D | V | L | L | S | G | Q | Q | D | D | G | V | Y | S | V | F | P | T | H | Y | P | A | G | F | Q | V | Y | C | D | M | R | T | D | G | G | G | W | T | V | F | Q | R | R | E | D | G | S | V | N | F | F | R | G | W | D | A | Y | R | D | G | F | G | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | G | G | G | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | T | G | E | H | W | L | G | L | K | R | I | H | A | L | T | T | Q | A | A | Y | E | L | H | V | D | L | E | D | F | E | N | G | T | A | Y | A | R | Y | G | S | F | G | V | G | L | F | S | V | D | P | E | E | D | G | Y | P | L | T | V | A | D | Y | S | G | T | A | G | D | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | L | K | H | S | G | M | R | F | T | T | K | D | R | D | S | D | H | S | E | N | N | C | A | A | F | Y | R | G | A | W | W | Y | R | N | C | H | T | S | N | L | N | G | Q | Y | L | R | G | A | H | A | S | Y | A | D | G | V | E | W | S | S | W | T | G | W | Q | Y | S | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | B | B | T | T | B | S | S | S | S | S | T | T | S | B | S | S | S | S | T | T | S | B | S | S | S | S | B | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | F | S | E | M | K | I | R | P | V | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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