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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4m5dB_ | PDB header: rna binding protein | Chain: B: PDB Molecule: ribosomal rna-processing protein 7; | PDBTitle: crystal structure of the utp22 and rrp7 complex from saccharomyces2 cerevisiae |
Added to library: Sat Nov 9 08:25:36 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | E | D | I | S | A | M | K | N | G | F | I | V | V | P | F | K | L | P | D | H | K | A | L | P | A | S | L | H | F | M | F | A | K | R | H | Q | S | S | N | S | N | E | S | D | C | L | F | L | V | N | L | P | L | L | S | N | I | E | H | M | K | K | F | V | G | Q | L | C | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | S | T | T | S | S | G | G | G | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | Y | D | T | V | S | H | V | E | E | L | L | Y | N | D | E | F | G | L | H | E | V | D | L | S | A | L | T | S | P | R | N | T | A | L | L | K | F | V | D | A | A | S | I | N | N | C | W | N | A | L | K | K | Y | S | N | L | H | A | K | H | P | N | E | L | F | E | W | T | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | G | G | G | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||
Sequence | T | T | P | S | F | T | T | F | V | N | F | Y | K | P | L | D | I | D | Y | L | K | E | D | I | H | T | H | M | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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