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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4m0hB_ | PDB header: signaling protein | Chain: B: PDB Molecule: conserved hypothetical protein, putative anti-sigma factor; | PDBTitle: crystal structure of a conserved hypothetical protein, putative anti-2 sigma factor (bdi_1681) from parabacteroides distasonis atcc 8503 at3 2.50 a resolution |
Added to library: Sat Oct 19 09:37:43 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | L | T | E | I | S | V | N | H | G | E | H | K | Q | V | T | L | P | D | G | T | V | V | H | L | N | A | G | T | V | X | R | Y | P | T | E | F | T | S | D | I | R | L | V | E | X | E | G | E | A | F | F | N | V | X | R | D | E | G | K | P | F | I | V | R | T | R | Q | A | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | K | V | L | G | G | S | F | N | V | K | A | Y | Q | E | D | E | L | X | A | V | S | V | R | T | G | K | V | E | V | D | X | P | E | S | V | X | R | L | L | P | N | E | Q | I | I | V | N | N | T | N | G | E | I | L | K | K | N | E | D | A | Q | K | V | T | A | W | L | Q | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | G | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | L | Y | F | N | R | T | P | I | S | S | V | I | H | D | L | E | R | X | Y | N | Q | E | I | V | L | D | P | N | V | V | F | D | D | Y | I | Y | G | E | H | D | N | K | S | L | E | A | V | L | N | A | I | Q | Y | S | T | G | I | R | Y | R | K | E | E | S | R | I | V | L | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | T | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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