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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4m01D_ | PDB header: cell adhesion | Chain: D: PDB Molecule: serine-rich adhesin for platelets; | PDBTitle: n terminal fragment(residues 245-575) of binding region of srap |
Added to library: Sat Jun 21 08:24:54 2014 | |
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Sequence | A | V | T | A | N | T | I | T | V | N | K | D | N | L | K | Q | Y | X | T | T | S | G | N | A | T | Y | D | Q | S | T | G | I | V | T | L | T | Q | D | A | Y | S | Q | K | G | A | I | T | L | G | T | R | I | D | S | N | K | S | F | H | F | S | G | K | V | N | L | G | N | K | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | G | H | G | N | G | G | D | G | I | G | F | A | F | S | P | G | V | L | G | E | T | G | L | N | G | A | A | V | G | I | G | G | L | S | N | A | F | G | F | K | L | D | T | Y | H | N | T | S | K | P | N | S | A | A | K | A | N | A | D | P | S | N | V | A | G | G | G | A | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | B | S | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | G | G | G | B | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | A | F | V | T | T | D | S | Y | G | V | A | T | T | Y | T | S | S | S | T | A | D | N | A | A | K | L | N | V | Q | P | T | N | N | T | F | Q | D | F | D | I | N | Y | N | G | D | T | K | V | X | T | V | K | Y | A | G | Q | T | W | T | R | N | I | S | D | W | I | A | K | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | T | T | N | F | S | L | S | X | T | A | S | T | G | G | A | T | N | L | Q | Q | V | Q | F | G | T | F | E | Y | T | E | S | A | V | T | Q | V | R | Y | V | D | V | T | T | G | K | D | I | I | P | P | K | T | Y | S | G | N | V | D | Q | V | V | T | I | D | N | Q | Q | S | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | B | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | |||||||||||||||
Sequence | L | T | A | K | G | Y | N | Y | T | S | V | D | S | S | Y | A | S | T | Y | N | D | T | N | K | T | V | K | X | T | N | A | G | Q | S | V | T | Y | Y | F | T | D | V | ||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | B | T | T | T | T | S | S |
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