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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4lurA_ | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: interphotoreceptor retinoid-binding protein(irbp); | PDBTitle: crystal structure of zebrafish interphotoreceptor retinoid-binding2 protein (irbp) module 1 |
Added to library: Sat Dec 13 11:48:26 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | S | P | T | L | I | A | D | X | A | K | I | F | X | D | N | Y | C | S | P | E | K | L | T | G | X | E | E | A | I | D | A | A | S | S | N | T | E | I | L | S | I | S | D | P | T | X | L | A | N | V | L | T | D | G | V | K | K | T | I | S | D | S | R | V | K | V | T | Y | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | D | L | I | L | A | A | P | P | A | X | P | D | I | P | L | E | H | L | A | A | X | I | K | G | T | V | K | V | E | I | L | E | G | N | I | G | Y | L | K | I | Q | H | I | I | G | E | E | X | A | Q | K | V | G | P | L | L | L | E | Y | I | W | D | K | I | L | P | T | S | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | X | I | L | D | F | R | S | T | V | T | G | E | L | S | G | I | P | Y | I | V | S | Y | F | T | D | P | E | P | L | I | H | I | D | S | V | Y | D | R | T | A | D | L | T | I | E | L | W | S | X | P | T | L | L | G | K | R | Y | G | T | S | K | P | L | I | I | L | T | S | K | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | L | G | I | A | E | D | V | A | Y | C | L | K | N | L | K | R | A | T | I | V | G | E | N | T | A | G | G | T | V | K | X | S | K | X | K | V | G | D | T | D | F | Y | V | T | V | P | V | A | K | S | I | N | P | I | T | G | K | S | W | E | I | N | G | V | A | P | D | V | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | S | S | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||
Sequence | V | A | A | E | D | A | L | D | A | A | I | A | I | I | K | L | R | A | E | I | P | A | L | A | Q | A | A | A | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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