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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4lqrA_ | PDB header: sugar binding protein | Chain: A: PDB Molecule: glycosyl hydrolase, family 31/fibronectin type iii domain | PDBTitle: structure of cbm32-3 from a family 31 glycoside hydrolase from2 clostridium perfringens |
Added to library: Sat Jul 26 08:29:51 2014 | |
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Sequence | Y | K | K | A | G | S | E | F | A | L | D | S | S | K | L | E | A | I | Y | A | T | S | E | A | D | R | D | Y | K | E | N | A | V | D | G | D | E | N | T | I | W | H | S | A | Y | Q | A | A | D | K | L | P | V | S | I | T | I | K | L | D | K | A | Y | D | L | N | Q | I | D | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | B | G | G | G | S | T | T | G | G | G | G | G | S | S | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | P | R | Q | N | S | R | N | G | H | V | T | E | Y | K | I | E | T | S | L | D | N | E | N | W | T | E | V | R | T | G | N | L | E | V | N | E | A | G | N | A | L | A | N | R | G | Y | N | P | I | R | F | N | T | I | N | A | Q | Y | L | R | F | T | A | L | K | T | L | G | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S | S | B | T | T | S | S | S | B | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | N | N | K | Y | A | S | A | A | E | L | V | F | Y | G | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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