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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4lp5A_ | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: advanced glycosylation end product-specific receptor; | PDBTitle: crystal structure of the full-length human rage extracellular domain2 (vc1c2 fragment) |
Added to library: Sat Oct 19 10:47:51 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | A | M | A | Q | N | I | T | A | R | I | G | E | P | L | V | L | K | C | K | G | A | P | K | K | P | P | Q | R | L | E | W | K | L | N | T | G | R | T | E | A | W | K | V | L | S | P | Q | G | G | G | P | W | D | S | V | A | R | V | L | P | N | G | S | L | F | L | P | A | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | I | Q | D | E | G | I | F | R | C | Q | A | M | N | R | N | G | K | E | T | K | S | N | Y | R | V | R | V | Y | Q | I | P | G | K | P | E | I | V | D | S | A | S | E | L | T | A | G | V | P | N | K | V | G | T | C | V | S | E | G | S | Y | P | A | G | T | L | S | W | H | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | B | S | S | T | T | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | G | K | P | L | V | P | N | E | K | G | V | S | V | K | E | Q | T | R | R | H | P | E | T | G | L | F | T | L | Q | S | E | L | M | V | T | P | A | R | G | G | D | P | R | P | T | F | S | C | S | F | S | P | G | L | P | R | H | R | A | L | R | T | A | P | I | Q | P | R | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | W | E | P | V | P | L | E | E | V | Q | L | V | V | E | P | E | G | G | A | V | A | P | G | G | T | V | T | L | T | C | E | V | P | A | Q | P | S | P | Q | I | H | W | M | K | D | G | V | P | L | P | L | P | P | S | P | V | L | I | L | P | E | I | G | P | Q | D | Q | G | T | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | C | V | A | T | H | S | S | H | G | P | Q | E | S | R | A | V | S | I | S | I | I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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