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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ln1B_ | PDB header: oxidoreductase | Chain: B: PDB Molecule: l-lactate dehydrogenase 1; | PDBTitle: crystal structure of l-lactate dehydrogenase from bacillus cereus atcc2 14579 complexed with calcium, nysgrc target 029452 |
Added to library: Sat Jul 27 08:32:42 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | N | L | Y | F | Q | S | X | K | K | G | I | N | R | V | V | L | V | G | T | G | A | V | G | C | S | Y | A | Y | C | X | I | N | Q | A | V | A | E | E | F | V | L | V | D | V | N | E | A | K | A | E | G | E | A | X | D | L | S | H | A | V | P | F | A | P | A | P | T | R | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | W | K | G | S | Y | E | D | C | K | D | A | D | L | V | V | I | T | A | G | L | P | Q | K | P | G | E | T | R | L | D | L | V | E | K | N | A | K | I | F | K | Q | I | V | R | S | I | X | D | S | G | F | D | G | I | F | L | I | A | T | N | P | V | D | I | L | T | Y | V | T | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | E | S | G | L | P | K | E | R | V | I | G | S | G | T | T | L | D | S | A | R | F | R | Y | X | L | G | E | Y | F | D | I | G | P | H | N | I | H | A | Y | I | I | G | E | H | G | D | T | E | L | P | V | W | S | H | V | S | V | G | I | Q | K | L | Q | T | L | L | E | K | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | S | G | G | G | B | S | T | T | T | T | G | G | G | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | N | T | Y | N | Q | E | D | L | D | K | I | F | I | N | V | R | D | A | A | Y | H | I | I | E | R | K | G | A | T | Y | Y | G | I | G | X | S | L | L | R | V | T | K | A | I | L | N | D | E | N | S | V | L | T | V | S | A | Y | L | E | G | Q | Y | G | Q | K | D | V | Y | I | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | |||||||||||||||||||
Sequence | V | P | A | V | L | N | R | G | G | V | R | E | I | L | E | V | E | L | S | E | D | E | E | L | K | F | D | H | S | V | Q | V | L | K | E | T | X | A | P | V | L | |||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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