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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4lgjA_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: uncharacterized protein; | PDBTitle: crystal structure and mechanism of a type iii secretion protease |
Added to library: Sat Jan 18 08:15:26 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | P | N | R | A | E | N | A | Y | A | D | Y | V | L | D | I | G | K | R | I | P | L | S | A | A | D | L | S | N | V | Y | E | S | V | I | R | A | V | H | D | S | R | S | R | L | I | D | Q | H | T | V | D | M | I | G | N | T | V | L | D | A | L | S | R | S | Q | T | F | R | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | S | T | T | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | V | S | Y | G | I | H | N | E | K | V | H | I | G | S | I | K | Y | R | N | E | Y | E | L | N | E | E | S | S | V | K | I | D | D | I | Q | S | L | T | S | N | E | L | Y | E | Y | D | V | G | Q | E | P | I | F | P | I | S | E | A | G | E | N | D | N | E | E | P | Y | V | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | T | T | S | S | G | G | G | G | G | G | G | T | S | S | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | S | V | A | P | D | T | D | S | Y | E | M | P | S | W | Q | E | G | L | I | H | E | I | I | H | H | V | T | G | S | S | D | P | S | G | D | S | N | I | E | L | G | P | T | E | I | L | A | R | R | V | A | Q | E | L | G | W | S | V | P | D | F | K | G | Y | A | E | P | E | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||
Sequence | E | A | H | L | R | L | R | N | L | N | A | L | R | Q | A | A | M | R | H | E | E | N | E | R | A | F | F | E | R | L | G | T | I | S | D | R | Y | E | A | S | P | D | F | T | E | Y | ||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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