|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4leuA_ | PDB header: rna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: pentatricopeptide repeat-containing protein at3g46870; | PDBTitle: crystal structure of tha8-like protein from arabidopsis thaliana |
Added to library: Sat Sep 28 08:38:08 2013 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | K | L | I | G | K | E | A | L | F | V | I | L | G | L | K | R | L | K | E | D | D | E | K | L | D | K | F | I | K | T | H | V | F | R | L | L | K | L | D | M | L | A | V | I | G | E | L | E | R | Q | E | E | T | A | L | A | I | K | M | F | E | V | I | Q | K | Q | E | W | Y | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | D | V | F | M | Y | K | D | L | I | V | S | L | A | K | S | K | R | M | D | E | A | M | A | L | W | E | K | M | K | K | E | N | L | F | P | D | S | Q | T | Y | T | E | V | I | R | G | F | L | R | D | G | C | P | A | D | A | M | N | V | Y | E | D | M | L | K | S | P | D | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | |||||||||||||||||
Sequence | P | E | E | L | P | F | R | V | L | L | K | G | L | L | P | H | P | L | L | R | N | K | V | K | K | D | F | E | E | L | F | P | E | K | H | A | Y | D | P | P | E | E | ||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|