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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4leeC_ | PDB header: cell adhesion | Chain: C: PDB Molecule: agglutinin-like protein 3; | PDBTitle: structure of the als3 adhesin from candida albicans, residues 1-3132 (mature sequence), triple mutant in the binding cavity: k59m, a116v,3 y301f |
Added to library: Sat May 17 08:25:03 2014 | |
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Sequence | G | K | T | I | T | G | V | F | N | S | F | N | S | L | T | W | S | N | A | A | T | Y | N | Y | K | G | P | G | T | P | T | W | N | A | V | L | G | W | S | L | D | G | T | S | A | S | P | G | D | T | F | T | L | N | M | P | C | V | F | M | F | T | T | S | Q | T | S | V | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | A | H | G | V | K | Y | A | T | C | Q | F | Q | A | G | E | E | F | M | T | F | S | T | L | T | C | T | V | S | N | T | L | T | P | S | I | K | A | L | G | T | V | T | L | P | L | V | F | N | V | G | G | T | G | S | S | V | D | L | E | D | S | K | C | F | T | A | G | T | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | V | T | F | N | D | G | G | K | K | I | S | I | N | V | D | F | E | R | S | N | V | D | P | K | G | Y | L | T | D | S | R | V | I | P | S | L | N | K | V | S | T | L | F | V | A | P | Q | C | A | N | G | Y | T | S | G | T | M | G | F | A | N | T | Y | G | D | V | Q | I | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | C | S | N | I | H | V | G | I | T | K | G | L | N | D | W | N | Y | P | V | S | S | E | S | F | S | Y | T | K | T | C | S | S | N | G | I | F | I | T | Y | K | N | V | P | A | G | Y | R | P | F | V | D | A | Y | I | S | A | T | D | V | N | S | Y | T | L | S | Y | A | N | E | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | T | S | B | S | B | S | S | T | T | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | ||||||||||||||||||||
Sequence | T | C | A | G | G | Y | W | Q | R | A | P | F | T | L | R | W | T | G | F | R | N | S | D | A | G | S | N | G | I | V | I | V | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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