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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4lb8A_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: A: PDB Molecule: uncharacterized protein; | PDBTitle: crystal structure of a hypothetical protein (bt3222) from bacteroides2 thetaiotaomicron vpi-5482 at 2.49 a resolution |
Added to library: Sat Jul 13 08:16:37 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | I | E | V | I | N | D | G | T | X | I | K | F | K | D | V | E | S | Y | E | N | A | L | L | K | V | S | A | X | S | T | S | E | Q | V | S | F | L | N | S | L | S | F | K | S | Q | X | I | L | X | Q | E | A | D | G | E | L | D | K | I | C | N | Q | A | A | D | K | A | E | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | V | L | Y | E | K | Y | K | H | K | Y | G | D | V | F | X | F | N | T | I | D | A | T | D | L | S | P | Y | S | R | L | V | Y | V | A | N | E | Y | F | V | N | X | K | G | E | F | X | I | G | D | S | L | V | V | D | K | V | Y | T | D | F | K | E | R | Q | Q | Q | F | T | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | B | S | S | T | T | B | B | S | S | G | G | G | G | G | T | T | T | S | T | T | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | T | R | S | S | V | S | D | L | S | S | I | N | E | A | Y | S | R | Q | K | D | R | K | V | G | L | Y | L | S | V | S | S | G | I | I | H | A | N | F | T | S | Q | K | K | G | V | F | G | W | S | R | Y | S | T | T | Y | H | A | K | V | N | L | R | G | F | E | F | A | Q | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | B | S | S | S | T | T | S | S | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . |
Sequence | E | L | L | G | Y | G | P | V | Y | V | N | K | D | G | I | P | F | A | I | D | T | K | E | X | G | G | N | V | T | K | V | F | G | R | K | L | A | Q | E | C | T | G | T | I | E | I | W | S | R | G | V | P | Y | D | Q | R | G | F | A | T | V | R | L | |||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | S | T | T | S | B | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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