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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4l6uB_ | PDB header: unknown function | Chain: B: PDB Molecule: putative uncharacterized protein; | PDBTitle: crystal structure of af1868: cmr1 subunit of the cmr rna silencing2 complex |
Added to library: Sat Feb 15 08:16:55 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | C | M | Y | S | A | T | F | T | L | E | A | I | T | P | V | F | M | E | I | R | A | A | S | I | K | G | L | M | R | W | W | F | R | A | L | S | G | S | Y | F | G | N | D | V | E | G | L | R | R | V | E | E | Y | V | F | G | S | T | K | R | E | S | R | V | V | V | E | V | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | E | H | V | E | E | R | F | C | P | L | P | M | V | W | K | K | K | K | G | V | T | T | R | V | S | Q | R | A | I | A | P | G | S | K | F | T | L | L | L | T | S | D | D | E | E | V | L | K | L | A | C | Y | S | L | I | G | L | V | Y | F | G | G | I | G | F | R | C | S | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | A | G | S | L | K | I | S | S | L | K | S | D | V | Q | L | I | D | L | P | K | N | K | N | Q | L | G | Q | M | V | N | D | L | T | V | E | I | A | K | I | L | K | K | T | F | L | C | D | H | E | S | Y | S | S | F | W | C | F | Y | L | F | L | W | G | E | K | A | E | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | V | Y | Y | R | S | N | N | L | E | N | E | R | L | T | L | L | D | L | F | E | K | E | F | K | N | K | N | N | H | A | S | P | I | K | V | G | I | T | E | L | S | E | K | Y | H | V | R | V | S | V | F | K | T | G | M | N | V | K | W | D | N | I | F | V | F | L | E | N | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | A | E | R | I | Y | P | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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