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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4l68A_ | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: leucine-rich repeat protein kinase-like protein; | PDBTitle: structure of the psedudokinase domain of bir2, an immune regulator of2 the rlk/pelle family |
Added to library: Sat Mar 8 09:05:59 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | L | A | Q | R | L | R | S | H | K | L | T | Q | V | S | L | F | Q | K | P | L | V | K | V | K | L | G | D | L | M | A | A | T | N | N | F | N | S | E | N | I | I | V | S | T | R | T | G | T | T | Y | K | A | L | L | P | D | G | S | A | L | A | V | K | H | L | S | T | C | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | B | S | S | S | S | B | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | G | E | R | E | F | R | Y | E | M | N | Q | L | W | E | L | R | H | S | N | L | A | P | L | L | G | F | C | V | V | E | E | E | K | F | L | V | Y | K | Y | M | S | N | G | T | L | H | S | L | L | D | S | N | R | G | E | L | D | W | S | T | R | F | R | I | G | L | G | A | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | T | T | T | T | B | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | G | L | A | W | L | H | H | G | C | R | P | P | I | L | H | Q | N | I | C | S | S | V | I | L | I | D | E | D | F | D | A | R | I | I | D | S | G | L | A | R | L | M | V | P | D | L | G | E | F | G | Y | V | A | P | E | Y | S | T | T | M | L | A | S | L | K | G | D | V | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | G | G | G | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | L | G | V | V | L | L | E | L | A | T | G | L | K | A | V | G | G | S | L | V | D | W | V | K | Q | L | E | S | S | G | R | I | A | E | T | F | D | E | N | I | R | G | K | G | H | D | E | E | I | S | K | F | V | E | I | A | L | N | C | V | S | S | R | P | K | E | R | W | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | G | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | |||||||||||||
Sequence | M | F | Q | A | Y | Q | S | L | K | A | I | A | E | K | Q | G | Y | S | F | S | E | Q | D | D | D | F | P | L | I | F | D | T | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S |
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