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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4l1nA_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: A: PDB Molecule: conserved lipoprotein, putative; | PDBTitle: crystal structure of a putative conserved lipoprotein (nt01cx_1156)2 from clostridium novyi nt at 2.70 a resolution |
Added to library: Sat Jun 29 08:23:09 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | N | S | K | K | X | F | L | K | K | E | L | G | K | N | S | K | P | T | F | A | T | K | W | K | N | S | S | N | N | K | F | S | A | C | I | E | G | K | G | E | N | A | L | E | E | G | V | G | K | I | Y | I | K | N | L | K | E | Q | S | K | W | E | L | D | L | D | Q | D | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | B | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | K | N | T | P | K | Y | I | D | W | F | D | D | N | N | L | X | V | V | I | S | R | A | H | G | T | V | S | Q | G | G | I | L | Y | K | V | N | I | E | T | G | Q | A | T | E | L | Y | N | T | K | D | N | K | K | Q | V | V | Y | A | V | K | K | G | D | K | I | D | V | Q | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | B | T | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | ||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | V | Y | E | D | D | D | L | L | E | S | H | E | E | T | K | T | I | T | V | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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