Fold library entry viewer: c4kmqA_

Added to library: Sat Jun 8 09:23:43 2013
Links to external resources

	1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70
Sequence	D	G	E	Y	H	S	P	Y	G	D	D	D	L	Y	T	V	Q	P	T	E	R	S	P	R	D	P	K	A	G	E	D	V	I	L	N	I	T	T	W	P	I	E	N	G	Q	D	V	W	V	E	W	T	K	N	G	V	A	Q	E	N	V	T	A	A	Y	D	Y	N	S	G
Predicted secondary structure
SS confidence
Known secondary structure (DSSP)							T	T	T	T			S	S				T	T				S	S	S		B	T	T											S			T	T										T	T															T
	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
Sequence	N	N	T	Y	W	K	A	D	L	G	K	F	E	K	G	D	E	I	T	Y	T	T	K	G	S	T	N	G	G	T	A	Y	E	S	G	P	F	T	F	Y	V	T	D	W	E	Y	V	Q	D	V	T	S	V	V	D	N	G	D	S	I	T	L	N	X	T	A	T	A	G	D
Predicted secondary structure
SS confidence
Known secondary structure (DSSP)	T													T	T												T	T														B															S	S									S	S	S	S
	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
Sequence	F	S	P	K	L	Y	L	S	F	E	D	L	D	T	L	R	X	E	L	S	P	T	G	K	E	T	G	H	A	G	K	S	G	Y	T	V	E	D	T	A	E	K	V	T	V	T	T	E	D	L	S	I	E	I	Q	K	S	P	Y	R	X	E	V	H	Q	A	D	G	T	L
Predicted secondary structure
SS confidence
Known secondary structure (DSSP)												T	T								S	S	S		S															S	S							S	S								T	T								T	T	S
	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
Sequence	L	T	S	E	Y	T	T	A	N	S	L	G	W	L	T	D	G	K	N	V	I	N	Q	Y	Q	N	N	F	X	T	P	S	D	E	A	F	Y	G	F	G	E	R	Y	D	T	I	N	Q	R	G	K	D	V	E	T	Y	V	Y	N	E	Y	Q	D	Q	A	Q	T	E	R	T
Predicted secondary structure
SS confidence
Known secondary structure (DSSP)				B		T	T	S									S	S	S													T	T								S		S	S		S			T	T												S						T
	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
Sequence	Y	L	A	V	P	F	F	V	S	A	N	K	Y	G	X	Y	V	N	S	D	F	H	S	Q	F	Q	X	A	S	K	V	E	D	K	Y	S	F	V	L	D	N	D	G	D	X	T	N	X	L	D	Y	Y	V	I	S	G	K	D	Q	N	D	I	V	N	N	Y	T	D	I	T
Predicted secondary structure
SS confidence
Known secondary structure (DSSP)	S	B								T	T	T								S	S							S	S	S	S	T	T												T	T											S	S
	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence	G	K	T	T	L	L	P	K	W	A	F	G	L	W	X	S	A	N	E	W	D	R	E	S	D	V	S	S	A	L	S	N	A	K	A	N	D	I	P	A	T	G	F	V	L	E	Q	W	S	D	E	E	T	Y	Y	I	W	N	N	A	T	Y	T	A	K	K	N	G	E	A
Predicted secondary structure
SS confidence
Known secondary structure (DSSP)								G	G	G	G	S						T	T			S														T	T									S	T	T	B		S	S	S	S	S	S	B	T	T		B					S	T	T
	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490
Sequence	F	S	Y	D	D	F	T	F	N	G	K	W	T	D	P	K	G	X	V	D	S	V	H	D	A	G	X	N	I	V	L	W	Q	V	P	V	L	K	D	D	G	T	V	Y	E	Q	R	D	N	D	E	E	Y	X	I	S	Q	G	Y	S	A	D	D	G	T	G	A	P	Y	R
Predicted secondary structure
SS confidence
Known secondary structure (DSSP)			G	G	G		B			T	T		S												T	T									S					S	S																	T		B		B		S	S	S	S	B		B
	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560
Sequence	V	P	A	S	Q	W	F	G	N	G	I	L	L	D	F	T	N	K	D	A	V	D	W	W	T	S	Q	R	E	Y	L	L	T	E	V	G	I	D	G	F	K	T	D	G	G	E	X	V	W	G	R	D	T	T	F	S	N	G	E	K	G	Q	E	X	R	N	R	Y	P	T
Predicted secondary structure
SS confidence
Known secondary structure (DSSP)			T	T	S	T	T	T	T				B		T	T																		T	S																S	S		B		T	T	S		B
	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630
Sequence	D	Y	V	S	S	Y	F	D	F	A	K	S	I	N	P	E	A	V	S	F	S	R	S	G	T	S	G	A	Q	K	S	G	I	Y	W	S	G	D	Q	T	S	T	F	D	S	F	Q	A	S	L	K	A	G	L	S	A	S	T	S	G	V	S	Y	W	A	W	D	X	A	G
Predicted secondary structure
SS confidence
Known secondary structure (DSSP)															T	T								B		T	T	G	G	G	S									B	S	S																	T	T			S				B	T	T
	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700
Sequence	F	T	G	D	Y	P	T	A	E	L	Y	K	R	A	T	A	X	A	A	F	A	P	I	X	Q	F	H	S	E	K	S	D	P	S	P	S	E	E	R	S	P	W	N	A	V	A	R	T	G	D	E	T	I	L	P	T	F	Q	K	Y	L	Y	T	R	X	N	L	L	P	Y
Predicted secondary structure
SS confidence
Known secondary structure (DSSP)	S	B	S	S																T	S	S	S								S	S		S	S					S											T	T															T
	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770
Sequence	I	Y	T	A	A	K	D	T	A	D	N	G	K	S	X	X	R	Q	X	A	X	D	Y	P	E	D	V	N	A	R	D	L	D	E	Q	Y	X	F	G	D	D	L	L	V	A	P	I	V	Q	E	G	Q	T	E	K	E	V	Y	L	P	E	G	E	W	V	D	I	W	N	G
Predicted secondary structure
SS confidence
Known secondary structure (DSSP)															S									T	T		G	G	G	T	T			S					T	T	T								S	T	T										S	S					T	T	T
	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence	G	V	H	P	G	G	E	T	I	S	Y	Y	A	D	V	D	T	L	P	V	F	A	K	A	G	A	I	I	P	X	N	X	T	D	G	Y	Q	L	G	Q	N	V	G	N	D	L	K	S	Y	D	N	L	T	F	R	V	Y	P	S	G	D	S	E	Y	S	F	Y	D	D	V
Predicted secondary structure
SS confidence
Known secondary structure (DSSP)					S	S									T	T								T	T									T	T			T	T					S		S	S			S										S									G	G
	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910
Sequence	N	G	G	E	X	R	D	I	S	V	S	E	D	F	A	N	E	K	V	S	V	D	L	P	A	X	A	D	E	T	T	X	Q	V	F	S	T	E	P	T	S	V	T	I	D	G	A	D	V	A	K	A	D	T	L	D	A	F	N	E	A	T	T	G	Y	Y	Y	D	T	V
Predicted secondary structure
SS confidence
Known secondary structure (DSSP)	G	T	T											G	G	G	T									B	S	S								S	S			S					T	T					B		S	S								S	S						T	T
	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980
Sequence	Q	N	L	T	Y	V	K	A	A	A	K	D	A	K	Q	A	I	V	L	N	G	V	N	H	A	P	Y	E	A	E	F	G	H	L	T	N	V	T	T	A	S	H	A	G	Y	T	G	T	G	F	V	A	G	F	D	A	E	K	E	A	V	E	F	D	I	D	A	V	D	G
Predicted secondary structure
SS confidence
Known secondary structure (DSSP)	T	T									B	S	S								S			S					G	G	G	S				S							T	T		S	T	T								S	T	T										T	T	S
	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050
Sequence	A	S	D	Y	T	X	E	V	R	Y	S	A	G	V	E	D	A	T	R	T	V	Y	I	N	G	K	K	Q	Q	I	T	L	P	K	T	A	N	W	D	T	W	N	T	V	E	V	P	V	T	L	Q	A	G	N	N	Q	V	V	F	D	F	E	A	D	D	T	A	G	I	N
Predicted secondary structure
SS confidence
Known secondary structure (DSSP)	S												S	S	S									T	T											S	S	T	T													S	S										T	T		B
	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence	F	D	H	V	V	I	K	K
Predicted secondary structure
SS confidence
Known secondary structure (DSSP)