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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4klzA_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: gtp-binding protein rit1; | PDBTitle: inhibition of small gtpases by stabilization of the gdp complex, a2 novel approach applied to rit1, a target for rheumatoid arthritis |
Added to library: Sat Sep 20 08:29:57 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | Y | K | L | V | M | L | G | A | G | G | V | G | K | S | A | M | T | M | Q | F | I | S | H | R | F | P | E | D | H | D | P | T | I | E | D | A | Y | K | I | R | I | R | I | D | D | E | P | A | N | L | D | I | L | D | T | A | G | Q | Y | M | R | A | G | E | G | F | I | I | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | S | I | T | D | R | R | S | F | H | E | V | R | E | F | K | Q | L | I | Y | R | V | R | R | T | D | D | T | P | V | V | L | V | G | N | K | S | D | L | K | Q | L | R | Q | V | T | K | E | E | G | L | A | L | A | R | E | F | S | C | P | F | F | E | T | S | A | A | Y | R | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | G | G | G | S | T | T | B | G | G | G | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Y | I | D | D | V | F | H | A | L | V | R | E | I | R | R | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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