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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4kitC_ | PDB header: rna binding protein | Chain: C: PDB Molecule: pre-mrna-processing-splicing factor 8; | PDBTitle: crystal structure of human brr2 in complex with the prp8 jab1/mpn2 domain |
Added to library: Sat Jun 8 09:07:40 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | S | S | K | T | E | W | R | V | R | A | I | S | A | A | N | L | H | L | R | T | N | H | I | Y | V | S | S | D | D | I | K | E | T | G | Y | T | Y | I | L | P | K | N | V | L | K | K | F | I | C | I | S | D | L | R | A | Q | I | A | G | Y | L | Y | G | V | S | P | P | D | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | Q | V | K | E | I | R | C | I | V | M | V | P | Q | W | G | T | H | Q | T | V | H | L | P | G | Q | L | P | Q | H | E | Y | L | K | E | M | E | P | L | G | W | I | H | T | Q | P | N | E | S | P | Q | L | S | P | Q | D | V | T | T | H | A | K | I | M | A | D | N | P | S | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | S | S | S | S | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | G | E | K | T | I | I | I | T | C | S | F | T | P | G | S | C | T | L | T | A | Y | K | L | T | P | S | G | Y | E | W | G | R | Q | N | T | D | K | G | N | N | P | K | G | Y | L | P | S | H | Y | E | R | V | Q | M | L | L | S | D | R | F | L | G | F | F | M | V | P | A | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | G | G | G | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | S | S | W | N | Y | N | F | M | G | V | R | H | D | P | N | M | K | Y | E | L | Q | L | A | N | P | K | E | F | Y | H | E | V | H | R | P | S | H | F | L | N | F | A | L | L | Q | E | G | E | V | Y | S | A | D | R | E | D | L | Y | A | |||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T | G | G | G | T | G | G | G | G | G | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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