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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4kfuC_ | PDB header: hydrolase | Chain: C: PDB Molecule: genome packaging ntpase b204; | PDBTitle: structure of the genome packaging ntpase b204 from sulfolobus turreted2 icosahedral virus 2 in complex with amppcp |
Added to library: Sat May 25 08:36:24 2013 | |
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Sequence | M | N | P | D | D | I | V | V | L | V | G | R | K | K | S | G | K | S | Y | L | I | K | H | Y | F | I | P | V | L | K | A | H | K | I | S | Y | I | I | D | D | H | S | E | Y | S | K | F | G | Y | N | A | T | S | L | S | D | I | V | S | K | Q | Y | V | V | V | Y | D | R | D | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S | G | G | G | S | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | E | K | L | W | Q | A | S | K | L | H | S | K | K | Y | G | T | T | V | L | I | I | D | E | A | Y | Y | H | F | K | Y | K | Q | K | V | T | P | A | I | D | E | A | L | H | A | N | R | H | A | G | L | G | L | I | L | S | T | Q | R | V | Y | D | L | M | P | I | V | Y | K | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | G | G | G | T | S | B | T | T | S | T | S | S | G | G | G | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . |
Sequence | A | D | L | I | I | M | F | Y | T | R | E | P | N | E | L | R | W | I | S | K | Y | I | S | A | E | A | A | E | K | V | K | T | L | K | Q | Y | H | F | L | I | Y | D | V | N | S | Q | T | I | K | I | H | K | P | I | L | |||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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