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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4kf8A_ | PDB header: structural protein | Chain: A: PDB Molecule: nup188; | PDBTitle: nup188(aa1445-1827) from myceliophthora thermophila |
Added to library: Sat Jun 22 08:28:35 2013 | |
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Sequence | S | L | L | P | K | D | I | S | Q | L | L | S | L | V | S | A | T | I | N | G | V | D | N | P | W | S | K | D | Q | I | S | Y | F | R | T | L | L | K | V | L | F | V | V | L | R | G | T | K | H | S | V | T | Q | L | V | L | T | T | L | D | R | V | V | A | R | S | F | R | N | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | A | L | V | A | A | T | T | P | E | D | L | A | L | I | T | A | I | L | Q | A | C | L | S | V | P | G | I | E | Q | C | Q | L | Q | V | L | N | I | X | S | S | H | N | V | L | Q | V | A | T | S | L | F | S | W | S | D | R | L | A | E | K | G | D | P | I | Y | G | E | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | G | G | G | G | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | L | L | L | L | E | L | S | A | L | P | A | L | A | E | Q | L | A | C | D | G | L | L | G | H | L | T | S | A | N | L | A | G | F | X | R | R | A | N | V | S | P | F | T | D | N | A | G | A | A | R | C | Y | A | I | W | A | K | G | I | L | P | L | L | L | N | I | L | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | T | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | G | A | T | I | A | P | E | V | A | F | V | L | N | Q | F | P | N | L | L | R | S | S | V | D | R | L | E | A | P | G | P | H | Y | F | V | A | L | V | A | L | S | E | V | H | S | L | A | L | L | T | R | V | L | A | A | L | R | S | G | N | A | R | D | I | P | E | V | V | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | T | T | B | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . |
Sequence | D | S | G | A | V | L | E | N | V | E | F | W | L | A | S | R | K | V | L | R | E | R | L | L | P | L | N | P | R | E | A | E | W | R | G | X | K | A | S | E | G | S | G | C | E | T | K | L | E | E | K | A | V | G | L | L | E | G | I | R | D | V | L | A | ||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | S | S | S | S | S | S | S |
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