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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4kemB_ | PDB header: lyase | Chain: B: PDB Molecule: mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme; | PDBTitle: crystal structure of a tartrate dehydratase from azospirillum, target2 efi-502395, with bound mg and a putative acrylate ion, ordered active3 site |
Added to library: Sat May 25 08:37:40 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | R | I | V | E | I | R | E | Q | T | A | G | I | K | S | D | I | A | N | A | F | I | D | F | S | Q | M | T | C | S | V | V | A | V | V | T | D | V | V | R | D | G | K | P | V | I | G | Y | G | F | N | S | N | G | R | Y | A | A | G | G | L | L | R | E | R | F | I | P | R | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | B | T | T | T | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | M | S | A | A | P | D | S | L | L | D | E | T | G | E | N | L | D | P | F | R | I | W | T | R | L | M | T | N | E | K | P | G | G | H | G | E | R | S | V | A | V | G | T | I | D | M | A | V | W | D | A | V | A | K | I | A | G | V | P | L | Y | R | L | L | A | D | R | F | R | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | G | G | G | G | B | T | T | S | S | S | B | T | T | T | S | S | S | S | T | S | B | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | V | A | D | D | G | V | W | V | Y | A | A | G | G | Y | Y | Y | P | G | K | D | V | K | A | L | Q | D | E | M | R | S | Y | R | D | R | G | Y | R | V | V | K | M | K | I | G | G | A | P | L | A | E | D | L | R | R | I | D | A | V | L | E | V | V | G | S | G | D | N | L | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | B | T | T | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | D | A | N | G | R | F | D | I | D | T | A | I | A | Y | G | E | A | L | K | P | Y | G | L | F | W | Y | E | E | A | G | D | P | L | D | Y | A | L | Q | A | E | L | A | K | H | Y | D | R | P | M | A | T | G | E | N | L | F | S | H | Q | D | A | R | N | L | I | R | H | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | M | R | P | D | R | D | W | L | Q | F | D | C | A | L | S | Y | G | L | V | E | Y | L | R | T | L | D | M | L | K | E | N | G | W | S | S | R | R | V | V | P | H | G | G | H | Q | M | S | L | N | I | A | A | G | L | H | L | G | G | N | E | S | Y | P | D | V | F | K | P | F | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T | G | G | G | B | S | S | T | S | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | ||||
Sequence | G | F | A | D | G | I | A | V | E | D | G | R | V | R | L | P | D | L | P | G | V | G | F | E | A | K | S | E | L | F | A | T | M | S | G | L | L | G | T | R | ||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | B | T | T | S | S | S | B | S | S | G | G | G | T |
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