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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4kc3B_ | PDB header: immune system | Chain: B: PDB Molecule: interleukin-1 receptor-like 1; | PDBTitle: cytokine/receptor binary complex |
Added to library: Sat Aug 31 09:52:16 2013 | |
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Sequence | S | K | Q | S | W | G | L | E | N | E | A | L | I | V | R | C | P | R | Q | G | K | P | S | Y | T | V | D | W | Y | Y | S | S | I | P | T | Q | E | R | N | R | V | F | A | S | G | Q | L | L | K | F | L | P | A | A | V | A | D | S | G | I | Y | T | C | I | V | R | S | P | T | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | R | T | G | Y | A | N | V | T | I | Y | K | K | Q | S | D | C | N | V | P | D | Y | L | M | Y | S | T | V | S | G | S | E | K | N | S | K | I | Y | C | P | T | I | D | L | Y | N | W | T | A | P | L | E | W | F | K | N | C | Q | A | L | Q | G | S | R | Y | R | A | H | K | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | G | G | G | S | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | L | V | I | D | N | V | M | T | E | D | A | G | D | Y | T | C | K | F | I | H | N | E | N | G | A | N | Y | S | V | T | A | T | R | S | F | T | V | K | D | E | Q | G | F | S | L | F | P | V | I | G | A | P | A | Q | N | E | I | K | N | L | T | C | S | A | C | F | G | K | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | T | Q | F | L | A | A | V | L | W | Q | L | N | G | T | K | I | T | D | F | G | E | P | R | I | Q | Q | E | E | G | G | L | A | C | L | D | M | V | L | R | I | A | D | V | K | E | E | D | L | L | L | Q | Y | D | C | L | A | L | N | L | H | G | L | R | R | H | T | V | R | ||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | B | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S |
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