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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4k5yC_ | PDB header: membrane protein, receptor | Chain: C: PDB Molecule: corticotropin-releasing factor receptor 1, t4-lysozyme | PDBTitle: crystal structure of human corticotropin-releasing factor receptor 12 (crf1r) in complex with the antagonist cp-376395 |
Added to library: Sat Jul 20 08:48:07 2013 | |
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Sequence | H | V | A | A | I | I | N | Y | L | G | H | C | I | S | L | V | A | L | L | V | A | F | V | L | F | L | R | A | R | S | I | R | C | L | R | N | I | I | H | A | N | L | I | A | A | F | I | L | R | N | A | T | W | F | V | V | Q | L | T | M | S | P | E | V | H | Q | S | N | V | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | G | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | W | C | R | L | V | T | A | A | Y | N | Y | F | H | V | T | N | F | F | W | M | F | G | E | G | C | Y | L | H | T | A | I | V | L | T | D | R | L | R | A | W | M | F | I | C | I | G | W | G | V | P | F | P | I | I | V | A | W | A | I | G | K | L | Y | Y | D | N | E | K | C | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | G | K | R | P | G | V | Y | T | D | Y | I | Y | Q | G | P | M | A | L | V | L | L | I | N | F | I | F | L | F | N | I | V | R | I | L | M | T | K | L | R | A | S | T | T | S | E | T | I | Q | A | R | K | A | V | K | A | T | L | V | L | L | P | L | L | G | I | T | Y | M | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | F | V | N | P | G | E | D | E | V | S | R | V | V | F | I | Y | F | N | A | F | L | E | S | F | Q | G | F | F | V | S | V | F | A | C | F | L | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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