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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4k5uD_ | PDB header: immune system | Chain: D: PDB Molecule: variable lymphocyte receptor; | PDBTitle: recognition of the bg-h antigen by a lamprey variable lymphocyte2 receptor |
Added to library: Sat Jun 29 08:42:04 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | C | P | S | Q | C | S | C | S | G | T | E | V | N | C | A | G | K | S | L | A | S | V | P | A | G | I | P | T | T | T | R | V | L | Y | L | N | S | N | Q | I | T | K | L | E | P | G | V | F | D | R | L | A | N | L | R | E | L | H | L | W | G | N | Q | L | V | S | L | P | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | V | F | D | N | L | A | N | L | E | K | L | W | L | N | S | N | Q | L | T | S | L | P | A | G | L | F | D | R | L | V | N | L | E | H | L | G | L | C | C | M | K | L | T | E | L | P | S | G | A | F | D | K | L | T | R | L | K | Q | L | G | L | D | Q | N | Q | L | K | S | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | D | G | A | F | A | R | L | P | S | L | T | H | V | W | L | H | T | N | P | W | D | C | Q | C | T | D | I | L | Y | L | S | G | W | V | A | Q | H | S | S | I | V | G | E | G | W | P | W | R | H | S | P | D | S | A | K | C | S | G | T | N | T | P | V | R | A | V | T | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | B | T | T | B | G | G | G | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T | S | B | B | T | T | T | B | G | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | S | T | S | P | S | K | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | B | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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