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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4k51A_ | PDB header: biosynthetic protein | Chain: A: PDB Molecule: eukaryotic translation initiation factor 3 subunit a; | PDBTitle: crystal structure of the pci domain of eif3a |
Added to library: Sat Jan 18 08:16:48 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | L | A | N | Y | Y | E | N | L | V | K | V | F | F | V | S | G | D | P | L | L | H | T | T | A | W | K | K | F | Y | K | L | Y | S | T | N | P | R | A | T | E | E | E | F | K | T | Y | S | S | T | I | F | L | S | A | I | S | T | Q | L | D | E | I | P | Y | D | P | H | L | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | M | Y | R | L | L | N | L | D | A | K | P | T | R | K | E | M | L | Q | S | I | I | E | D | E | S | I | Y | G | K | V | D | E | E | L | K | E | L | Y | D | I | I | E | V | N | F | D | V | D | T | V | K | Q | Q | L | E | N | L | L | V | K | L | S | S | K | T | Y | F | S | Q | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | T | S | T | T | T | T | T | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | A | P | L | R | D | V | I | M | R | R | V | F | V | A | A | S | Q | K | F | T | T | V | S | Q | S | E | L | Y | K | L | A | T | L | P | A | P | L | D | L | S | A | W | D | I | E | K | S | L | L | Q | A | A | V | E | D | Y | V | S | I | T | I | D | H | E | S | A | K | V | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | F | A | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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