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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4k1pG_ | PDB header: toxin | Chain: G: PDB Molecule: nhea; | PDBTitle: structure of the nhea component of the nhe toxin from bacillus cereus |
Added to library: Sat Sep 21 08:32:46 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | L | S | N | S | I | R | M | L | G | S | Q | S | P | L | I | Q | A | Y | G | L | V | I | L | Q | Q | P | D | I | K | V | N | A | M | S | S | L | T | N | H | Q | K | F | A | K | A | N | V | R | E | W | I | D | E | Y | N | P | K | L | I | D | L | N | Q | E | M | M | R | Y | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | - | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | R | F | N | S | Y | Y | S | K | L | Y | E | L | A | G | N | I | N | E | Q | S | K | A | D | F | T | N | A | Y | G | K | L | Q | L | Q | V | Q | S | I | Q | E | N | M | E | Q | D | L | L | E | L | N | R | F | K | T | V | L | D | K | D | S | N | N | L | S | I | K | A | D | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | I | K | T | L | Q | D | I | V | K | L | R | E | D | I | K | R | I | Q | G | E | I | Q | A | E | L | T | T | I | L | N | R | P | Q | E | I | I | K | G | S | I | N | I | G | K | Q | V | F | T | I | T | K | T | I | D | F | V | S | I | G | T | L | S | N | E | I | V | N | A | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | S | Q | T | R | E | A | A | L | R | I | Q | Q | K | Q | K | E | L | L | P | L | I | Q | K | L | S | Q | T | E | A | E | A | T | Q | I | T | F | V | E | D | Q | V | S | S | F | T | E | L | I | D | R | Q | I | T | T | L | E | T | L | L | T | D | W | K | V | L | N | N | N | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | Q | I | Q | K | N | V | E | E | S | S | L | L | Q | K | H | F | N | Q | I | K | K | V | S | D | E | M | N | K | Q | T | N | Q | F | E | D | Y | V | T | N | V | E | V | H | ||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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