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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4jq6A_ | PDB header: proton transport | Chain: A: PDB Molecule: proteorhodopsin; | PDBTitle: crystal structure of blue light-absorbing proteorhodopsin from med122 at 2.3 angstrom |
Added to library: Sat May 11 08:26:15 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | Y | V | G | I | S | F | W | L | A | A | A | I | M | L | A | S | T | V | F | F | F | V | E | R | S | D | V | P | V | K | W | K | T | S | L | T | V | A | G | L | V | T | G | V | A | F | W | H | Y | L | Y | M | R | G | V | W | I | Y | A | G | E | T | P | T | V | F | R | Y | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | W | L | I | T | V | P | L | Q | I | I | E | F | Y | L | I | I | A | V | F | W | K | L | L | I | A | S | L | V | M | L | I | G | G | F | I | G | E | A | G | L | G | D | V | V | V | W | W | I | V | G | M | I | A | W | L | Y | I | I | Y | E | I | F | L | F | N | T | I | K | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||
Sequence | I | V | T | V | G | W | A | I | Y | P | I | G | Y | A | W | G | Y | F | G | D | G | L | N | E | D | A | L | N | I | V | Y | N | L | A | D | L | I | N | K | A | A | F | G | L | A | I | W | A | A | A | M | K | D | K | E | T | S | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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