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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4joqA_ | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: abc ribose transporter, periplasmic solute-binding protein; | PDBTitle: putative ribose abc transporter, periplasmic solute-binding protein2 from rhodobacter sphaeroides |
Added to library: Sat Apr 13 09:02:30 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | N | A | Q | E | K | V | G | T | I | G | I | A | I | P | S | A | T | H | G | F | X | G | G | L | N | F | H | A | Q | D | T | I | K | R | L | Q | E | V | Y | P | Q | L | D | F | V | L | A | T | A | G | N | A | G | K | X | V | N | D | I | E | D | X | V | A | T | R | N | I | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | L | V | V | L | P | F | E | S | E | P | L | T | S | P | V | Q | A | V | K | E | A | G | I | W | V | T | V | V | D | R | G | L | S | V | E | G | I | E | D | L | Y | V | A | G | D | N | P | G | F | G | R | V | A | G | E | Y | F | A | Q | H | L | E | S | G | K | K | I | V | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | R | G | I | P | T | T | L | D | N | E | R | V | E | A | F | T | A | A | I | E | G | S | G | I | E | V | L | D | X | Q | H | G | N | W | N | R | D | D | A | F | N | V | X | Q | D | F | L | S | K | Y | P | Q | I | D | A | V | W | A | A | D | D | D | X | A | I | G | A | X | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | I | A | Q | A | G | R | T | E | E | X | W | V | X | G | G | A | G | X | K | E | I | I | R | R | I | A | D | G | D | P | Q | L | P | A | N | V | T | Y | P | P | A | Q | I | S | T | A | I | E | L | T | A | L | K | L | V | S | S | T | P | V | S | G | R | F | I | I | G | S | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | V | T | P | E | N | A | E | Q | F | Y | F | P | D | S | P | F | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G | G | G | G | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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