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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4jmgA_ | PDB header: de novo protein | Chain: A: PDB Molecule: clamp ptpn11_py580; | PDBTitle: crystal structure of the synthetic protein in complex with py peptide |
Added to library: Sat Apr 26 08:44:35 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | K | F | N | S | L | N | E | L | V | D | Y | H | R | S | T | S | V | S | R | N | Q | Q | I | F | L | R | D | I | G | G | H | P | W | Y | K | G | K | I | P | R | A | K | A | E | E | M | L | S | K | Q | R | H | D | G | A | F | L | I | R | E | S | E | S | A | P | G | D | F | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | B | S | S | T | S | S | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | S | V | K | F | G | N | D | V | Q | H | F | K | V | L | R | D | G | A | G | K | Y | F | L | W | V | G | G | S | G | G | S | V | S | S | V | P | T | K | L | E | V | V | A | A | T | P | T | S | L | L | I | S | W | D | A | W | S | G | S | D | W | P | V | S | Y | Y | R | I | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | Y | G | E | T | G | G | N | S | P | V | Q | E | F | T | V | P | G | S | S | Y | T | A | T | I | S | G | L | S | P | G | V | D | Y | T | I | T | V | Y | A | G | Y | D | G | K | Y | Y | Y | Q | S | P | I | S | I | N | Y | R | T | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | B | S | S | S | S | B | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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