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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4jioA_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: bro1; | PDBTitle: bro1 v domain and ubiquitin |
Added to library: Sat Jun 22 10:54:49 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | F | T | E | I | Y | E | K | E | S | I | Y | S | E | E | K | A | Q | L | L | R | K | E | X | E | S | V | E | T | A | D | L | E | Y | T | S | F | V | E | F | T | N | L | P | K | L | I | N | D | L | A | A | A | Y | T | P | Q | L | E | X | X | R | D | Q | I | K | S | W | A | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | V | Q | Q | N | E | F | N | D | I | E | R | I | I | N | V | I | S | S | K | R | K | E | I | L | D | I | L | A | L | P | A | E | E | K | E | N | I | L | K | L | K | A | S | L | V | E | A | S | Q | S | D | E | K | L | F | R | L | I | K | P | Y | V | A | E | I | K | L | L | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | D | S | S | L | W | R | K | F | D | D | S | K | T | E | L | I | L | S | K | L | K | A | I | T | Q | F | A | E | D | L | R | L | L | K | E | E | R | A | R | T | X | G | E | L | K | D | Y | V | N | N | N | D | D | I | T | S | L | L | L | A | N | K | D | K | S | D | A | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | Q | S | L | F | E | S | E | L | A | K | F | E | P | L | T | T | R | I | E | A | T | I | F | K | Q | G | S | T | I | N | G | V | K | I | E | L | D | N | I | F | G | L | T | G | I | Q | D | K | T | P | E | E | Q | K | A | E | L | E | R | K | L | F | F | D | K | L | E | E | A | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | K | F | T | I | F | S | S | D | I | Q | K | G | L | N | F | Y | N | S | L | L | K | X | S | K | D | L | Q | N | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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