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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4jigA_ | PDB header: oxidoreductase | Chain: A: PDB Molecule: dehydrogenase; | PDBTitle: crystal structure of a putative dehydrogenase from burkholderia2 cenocepacia |
Added to library: Sat Apr 13 09:03:30 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | S | D | R | K | A | V | L | I | T | G | A | S | R | G | I | G | R | A | T | A | V | L | A | A | E | R | G | W | D | V | G | I | N | Y | A | R | D | A | A | A | A | E | L | T | A | Q | A | V | R | D | A | G | G | R | A | C | I | V | A | G | D | V | A | N | E | A | D | V | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | M | F | D | T | V | A | A | A | F | G | R | L | D | A | L | V | N | N | A | G | I | V | A | P | S | M | P | L | A | D | M | P | V | D | R | L | R | R | M | F | D | T | N | V | L | G | A | Y | L | C | A | R | E | A | A | R | R | L | S | T | D | R | G | G | R | G | G | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | N | V | S | S | I | A | S | R | L | G | S | P | N | E | Y | V | D | Y | A | G | S | K | G | A | V | D | S | L | T | I | G | L | A | K | E | L | G | P | H | G | V | R | V | N | A | V | R | P | G | L | I | E | T | R | L | G | A | Q | T | P | L | G | R | A | G | E | A | Q | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | T | S | B | G | G | G | S | T | T | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | V | A | E | A | I | V | W | L | L | G | D | T | A | S | Y | T | T | G | A | L | L | D | V | G | G | G | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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