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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4jhmC_ | PDB header: isomerase | Chain: C: PDB Molecule: mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme, c- | PDBTitle: crystal structure of a putative mandelate racemase/muconate2 lactonizing enzyme from pseudovibrio sp. |
Added to library: Sat May 4 08:56:19 2013 | |
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Sequence | E | D | C | R | I | S | R | V | E | L | Y | A | L | A | D | E | N | A | P | P | I | P | W | A | D | N | Q | E | P | L | L | Y | T | N | N | I | V | R | L | F | T | E | D | G | T | E | G | L | G | A | T | X | S | Y | T | E | N | F | F | D | R | C | I | I | E | S | L | R | T | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | P | G | L | I | G | K | N | P | L | X | T | Q | E | L | N | N | W | L | G | A | R | C | T | W | G | G | L | P | A | K | S | P | I | D | I | A | A | W | D | I | K | G | K | K | A | G | X | P | L | Y | X | L | L | G | G | A | R | T | K | I | K | S | Y | A | S | T | P | X | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | T | T | T | T | S | T | S | T | T | T | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | T | V | E | E | Y | F | P | Y | I | D | D | C | I | E | H | G | F | T | A | I | K | L | H | C | Y | C | V | Y | D | K | D | V | A | L | V | E | A | V | E | A | K | Y | G | T | S | G | I | R | F | X | L | D | T | A | G | F | Y | T | P | E | Q | A | X | K | X | A | K | W | X |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | S | S | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | R | H | N | W | E | W | L | E | A | P | V | S | D | Y | D | F | K | T | Y | Q | R | L | V | A | N | T | D | L | E | I | S | S | H | G | N | C | L | L | T | L | Q | E | V | T | H | A | L | S | T | G | X | W | S | D | V | R | Q | D | A | T | V | C | G | G | I | T | Q | L | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | K | C | F | A | I | A | A | G | H | S | K | N | L | E | I | Q | S | X | G | Y | T | L | T | Q | A | A | N | L | H | V | A | L | A | H | D | N | C | N | F | F | E | Q | F | Y | P | Y | E | A | F | E | L | A | S | K | T | Q | I | R | T | D | K | E | G | Y | V | H | A | P | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G | G | T | T | B | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||
Sequence | N | G | L | G | V | E | X | D | W | D | A | V | K | E | A | S | F | A | S | Y | V | F | E | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | B | T |
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