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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4jdoG_ | PDB header: cell invasion | Chain: G: PDB Molecule: virulence plasmid protein pgp3-d; | PDBTitle: secreted chlamydial protein pgp3, coiled-coil deletion |
Added to library: Sat Jun 8 09:14:37 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | X | G | N | S | G | F | Y | L | Y | N | T | E | N | C | V | F | A | D | N | I | K | V | G | Q | X | T | E | P | L | K | D | Q | Q | I | I | L | G | T | K | S | T | P | V | A | A | K | X | T | A | S | D | G | I | S | L | T | V | S | N | N | S | S | T | N | A | S | I | T | I | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | L | K | A | F | N | N | F | P | I | T | N | K | I | Q | C | N | G | L | F | T | P | S | N | I | E | T | L | L | G | G | T | E | I | G | K | F | T | V | T | P | K | S | S | G | S | X | F | L | V | S | A | D | I | I | A | S | R | X | E | G | G | V | V | L | A | L | V | R | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | D | S | K | P | C | A | I | S | Y | G | Y | S | S | G | V | P | N | L | C | S | L | R | T | S | I | T | N | T | G | L | T | P | T | T | Y | S | L | R | V | G | G | L | E | S | G | V | V | W | V | N | A | L | S | N | G | N | D | I | L | G | I | T | N | T | S | N | V | S | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | S | S | S | B | S | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | E | V | I | P | Q | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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